白赖仁（李子雄 饰）野心勃勃，一心想控制人类，差仁者领袖虎大介杀死了菊池博士，抢走了万能的“赤盒”，伹他却打不开。得知音乐家高比（黄子华 饰）能打开盒子，他遂派人将其生擒。与此同时，菊池的学生女忍者香也在追杀高比，而令一面，芭蕉先生派爱徒小灵（黄圣依 饰）则暗中保护高比。三路人马狭路相逢，展开龙争虎斗，最终小灵杀出重围。芭蕉夜入白府盗赤盒不成，反被虎大介取走性命，并连累村民惨遭屠杀，于心不忍的高比以自刎相威胁，总算中止了白赖仁的屠夫行径。高比以乐曲为钥匙打开了赤盒，白赖仁惊喜万分，以为掌握了控制人类的秘笈。但小灵、女忍者香能就此罢手吗......
《终极忍者》是由邱礼涛执导并编剧，黄子华、黄圣依、李子雄主演的电影，于2006年4月30日在中国内地上映。[1]
该片讲述了白赖仁野心勃勃，一心想控制人类，抢走了万能的“赤盒”，伹他却打不开。得知音乐家高比能打开盒子，他遂派人将其生擒。与此同时，菊池的学生女忍者香也在追杀高比。而令一面，芭蕉先生派爱徒小灵则暗中保护高比。三路人马狭路相逢，展开龙争虎斗的故事。
野心家白赖仁（李子雄饰）为了实现控制人类的梦想，派出手下甲贺忍者领袖虎大介追杀菊池博士，成功抢走了他身上的“赤盒”——一个收藏着菊池发明，可以抵抗任何病毒的药苗“人类”之小盒子！
菊池死后，白赖仁才发现世上只有一个叫高比（黄子华饰）的潦倒音乐家才拥有打开“赤盒”之能力，遂派虎大介生擒高比，另一方面，菊池徒弟伊贺女忍者香也发誓要完成师傅遗愿---“杀高比”，而另一边，伊贺派芭蕉先生却派爱徒小灵（黄圣依饰）保护高比，免落入坏人手上。
三路人马碰头，展开龙争虎斗，高比夹在当中，叫苦不已。最后小灵趁着虎大介对香手下留情的刹那机会，带着二人杀出重围，逃回雾隐村。原来香和虎大介是青梅竹马恋人，碍于门派斗争，有情人难成眷属。香唯有暂在芭蕉家养伤。
芭蕉决定冒险潜入白赖仁总部盗取“赤盒”，谁料中了反间之计，连累村民惨遭大屠杀，最后死在虎大介手上。结果高比挺身而出，大呼若不停止杀人，便自刎当场。高比被押回白赖仁总部，竟无意中以一曲将“赤盒”成功打开，原来当日菊池被此曲吸引，遂以此作为钥匙。
小灵、香杀进白赖仁总部，一场激战之后，尽杀白赖仁及其党羽，救出高比及夺回“赤盒”，而二女也运用易容术互调身份之苦肉计，令虎大介上当---当他惊觉伤在自己手上的竟是香时，即被香以剩余之最后一口气用刀刺入自己身体……但香眼中亦同时流下两行情泪……