《白玫瑰在行动》讲述第二次世界大战期间，德国慕尼黑玛克西米利安大学的索菲等几名大学生，为了推翻法西斯统治和结束战争，建立了一个名为“白玫瑰”的抵抗组织。他们印刷、散发传单，号召德国人民起来反对纳粹，并开展种种破坏活动。渐渐的这支“白玫瑰”小组影响力扩大，得到了许多学生的支持，然而盖世太保是不会让这支“白玫瑰”继续绽放的。
1942 年，慕尼黑。包括绍尔兄弟在内的白玫瑰学生团体散发传单，呼吁抵抗希特勒及其政权。他们冒着生命危险，向其他城市散发传单，并在夜间在房屋墙壁上写下“打倒希特勒”等标语。随着盖世太保对学生的绞索收紧，他们与其他抵抗组织甚至高级军事官员进行了接触。1943 年初，盖世太保发动袭击。汉斯·绍尔和索菲·绍尔在慕尼黑大学庭院被捕。由弗赖斯勒主持的人民法院判处他们死刑。1943年2月22日作出判决。
导演在片尾字幕中指出，影片完成时，人民法院的死刑判决仍然有效。直到1998年，人民法院的判决才被废除国家社会主义刑事司法错误判决的法律推翻。