近未来，金融危机席卷美国，失业率和犯罪率飙升，各大主要城市纷纷爆发抗议与动乱。始终与超级英雄作对的莱克斯•卢瑟摇身一变成为总统候选人，他采取强硬的手段镇压暴动，并向选民许下美好前景，最终他如愿以偿当上美国总统。上任之初，卢瑟强化国家集权，先后将原子队长、黑闪、力量女神、武士刀等超级战士招至麾下，其声势空前壮大。而超人和蝙蝠侠对卢瑟的做法心存顾虑，始终不与之合作。
与此同时，一颗小行星飞临地球。卢瑟以联手阻止小行星为由与超人会面，结果却派出金属电子人对超人进行攻击。一番激战过后，超人在蝙蝠侠的帮助下侥幸逃脱，而金属电子人则被神秘之人杀害，卢瑟据此栽赃超人。曾经的超级英雄一瞬间成为公众之敌……
莱克斯·卢瑟 (Lex Luthor)在全国经济严重萧条期间当选总统。在他的领导下，经济开始蓬勃发展，他组建了一支政府雇佣的超级英雄队伍，包括原子队长、武士刀、黑闪电、神力女孩、星火和少校。尽管神力女孩热衷于和平与稳定，原子队长也忠于政府，但超人和蝙蝠侠仍然对卢瑟不信任。
美国政府发现一颗巨大的氪石流星正冲向地球。卢瑟没有向超级英雄寻求援助，而是决定用核导弹摧毁它。卢瑟以休战为借口安排在哥谭市与超人会面，结果却与雇佣的金属人与超人和蝙蝠侠发生了一场战斗，金属人在一名身份不明的袭击者杀死他之前设法伤害了他们两人。在国家电视台上，卢瑟将梅塔洛的谋杀归咎于超人，使用经过修改的战斗镜头来暗示他，并毫无根据地声称氪星辐射会影响超人的判断，然后悬赏十亿美元追捕超人。
蝙蝠侠和超人闯入STAR 实验室寻找有关流星的信息，并找到了金属的遗骸；他们意识到放射性能量爆炸杀死了他，并且它看起来像超人的热视觉。一群想要收集赏金的恶棍袭击了他们。超人和蝙蝠侠轻松击败了大多数恶棍，而原子队长则用巨大的能量爆炸击败了其余的人。卢瑟的所有超级英雄团队除了忠诚度不一的神力女孩外，都试图抓住这对英雄二人组，直到超人利用他的超速度制造了一场龙卷风，两位英雄与神力女孩一起逃脱。
在《大都会》中，Power Girl 承认她不相信超人杀死了 Metallo，并且不喜欢 Luthor。卢瑟的超级英雄追上来，战斗重新开始，神力女孩帮助蝙蝠侠和超人，直到蝙蝠侠推断出少校在卢瑟的命令下杀死了金属，并怂恿他在所有人面前承认这一点。当少校突然爆发并试图杀死他时，一名愤怒的超能女孩狠狠地打了他一拳，打碎了他的防护服，释放了他的辐射。原子队长吸收了能量，瓦解了原力少校并使他陷入昏迷。
与此同时，由于流星发出的辐射在撞击前引爆导弹，导弹失败了。阿曼达·沃勒发现卢瑟一直在秘密服用由增强力量的类固醇和液体氪石组成的血清。卢瑟随后告诉沃勒，他将让流星撞击地球，因为他计划按照自己的形象重建社会，成为地球的唯一领导者。蝙蝠侠和超人与惊奇队长和鹰人战斗，然后闯入卢瑟的行动基地取回流星数据。卢瑟拒绝放弃这些数据，甚至将其从实验室计算机中删除，但沃勒给了他们一份副本。蝙蝠侠、超人和神力女孩前往东京，将数据交给玩具曼已经建造了一艘巨型火箭推进的飞船，打算用它作为大型导弹来阻止流星。沃勒和军方随后试图逮捕卢瑟，但卢瑟给自己注射了更多氪石类固醇，并穿上了配备氪石武器的动力服。逃离沃勒和军队后，卢瑟跟随超人和蝙蝠侠出国，打算亲手杀死超人。
蝙蝠侠和超人到达玩具曼的实验室后，他向他们展示了宇宙飞船，它类似于超人和蝙蝠侠的巨型机器人复合版本，并利用数据进行加固，使其在撞击前不会爆炸。然而，卢瑟到达并压制了超能女孩、超人和蝙蝠侠，并禁用了火箭的远程制导系统，使其无法自行起飞。在别无选择的情况下，蝙蝠侠不顾超人的抗议，决定亲自驾驶火箭。尽管一开始表现不佳，超人最终还是毁掉了卢瑟的战甲，并被原子队长和他的团队逮捕。蝙蝠侠成功摧毁了流星，并乘坐逃生舱返回地球。
随着金属之死的真相现已广为人知，超人被洗清了谋杀罪名，而卢瑟则被捕并因其罪行而接受审判和弹劾。蝙蝠侠返回哥谭，而《星球日报》的明星记者露易丝·莱恩也抵达并拥抱了超人。