《名侦探柯南：瞳孔中的暗杀者》是由儿玉兼嗣执导，高山南、山崎和佳奈、神谷明等人参与配音的动画电影。于2000年4月22日在日本上映。该作品是《名侦探柯南》的第4部剧场版电影。
影片讲述了柯南破获与警察内部有关的婚宴枪击案，并在游乐园救小兰的故事。 [1]
2022年6月1日，B站宣布正式启动动画4K修复计划，首批修复完成的作品包括《名侦探柯南：瞳孔中的暗杀者（中配版）》。 [5]
柯南在街头目睹一名正打电话的警察在雨中被射杀，忙将凶手追踪，但凶手逃脱。死者闭眼一刻紧抓左胸，似乎有所暗示。事后柯南从目暮警官口中了解到紧抓左胸是暗示那里有警察手册。不久又有警察手拿警察手册被人射杀于地下车库。对于这两起案件，目暮警官等人一反常态不愿向毛利小五郎及柯南透露太多信息。毛利不甘心进一步追问，白鸟警官只答一句“Neednottoknow”。该话是警察之间所用的密语，意味这两起杀人事件与警察内部人士有关。柯南、小兰等人参加白鸟妹妹的婚宴，电突然间停掉，那刻小兰正与女警佐藤在洗手间。小兰拿起身边的手电筒欲照明时，一颗子弹射进佐藤身体，小兰吓昏过去。次日小兰醒来，却因怪责自己害佐藤挨枪失去记忆。目暮见事态越来越严重，将秘密说出，原来死去的两名警察正与佐藤一起重查一桩有关医生仁野自杀的案件，该案涉及到警察局长的公子。将局长公子假定为嫌疑人之一时，柯南亦想到佐藤被射杀后宴会上少掉的两个人。
专针对警察的连续杀人案件发生了，已经连续两位东京警视厅的现任刑事惨遭杀害，而遇害的两位刑事都手握警察手册气绝身亡。 这意味着什么，是对付警察的恐怖行为、或是过激派的暴行。警视厅正对此凶杀案件有关的人事物及警察组织内部着手进行搜查。 而警视厅的内部秘密却如高墙般难以窥探。
柯南与毛利小五郎前往警视厅向目暮警官、白鸟警官查询有关杀人事件的情报，但他们却意外地守口如瓶。在小五郎努力追问下，却得到白鸟警官一句：Need not to know（无须知道）这是警察之间所用的密语，也就是说杀人事件与警察内部有关。
毛利小五郎、柯南和众多警察参加白鸟警官妹妹的婚宴，席间突然停电，小兰和佐藤美和子警官都在厕所中，正当小兰拿起身旁的手电筒时枪声却响起，而佐藤警官也为了保护小兰而挨枪。听到枪声的小五郎等人涌入厕所时犯人却已不留痕迹地脱逃了。这时，小兰却因承受不了佐藤警官重伤昏迷的打击，从而患了逆性健忘！虽然记不起身边的事，但却可以照顾自己的日常生活。失去记忆的兰不断受到犯人的攻击，为了找回记忆，众人带兰去热带公园，却误认为找到真凶而放松警惕。此时，找出真凶的柯南赶往乐园保护兰，最后在喷水池中，兰想起了以前和新一的事，找回了记忆，并狠揍了一顿犯人。最后在大家的帮助下，犯人成功抓住。 [1]