为了追求自己的“兔”生意义，年少轻狂的比得（詹姆斯·柯登JamesCorden配音）踏上了背井离乡的路并成功赢得老江湖巴拿巴的青睐、成为了团伙中的扛把子，怎料却将追随而来的昔日老友们推入死亡陷阱。幡然醒悟后，比得化身“兔界阿汤哥”带领同伴展开海陆空三栖大营救。高空跳伞、水下救援、雪山速滑、快艇追击，无所不能。在这场冒险旅途中，比得收获了友情，理解了亲情，最终实现了自我成长，成为真正的“兔一哥”。
在第一部电影的事件发生后的某个时间，托马斯和比亚结婚了，他们所有的朋友，人类和动物都参加了，彼得接受了他生活的这个新部分。蜜月结束后，托马斯帮助碧根据彼得和他的朋友们编写儿童故事书。彼得有点失望地知道书中将他描绘成“顽皮”，并且不想考虑托马斯和比亚在没有他的情况下组建自己的家庭。随后，比亚收到了一封来自出版商的信件，想要发行她的书。托马斯和比亚带着彼得、本杰明、弗洛普西、莫普西和棉尾去见出版商奈杰尔·巴兹尔-琼斯，后者提出了他针对兔子的营销计划，将彼得描绘成一个麻烦制造者。他们甚至看到了潜在的彼得兔电影的广告牌，这让他看起来非常邪恶。
沮丧的彼得离开人群，进城，在那里他遇到了一只名叫巴拿巴的老兔子。在又搞了一些恶作剧之后，当他们从麦格雷戈农场偷食物时，巴拿巴认出了彼得是他老朋友的儿子。他对彼得的动作和技巧印象深刻，但不幸的是他们被动物捕手抓住，并把他们带到了宠物收容所在那里，他们被一个名叫阿米莉亚的小女孩收留。经过一个下午的清洗和粗暴玩耍后，巴拿巴释放了自己和彼得，他们在巴拿巴手下的帮助下去搜查家里的冰箱。当他们试图偷偷把食物偷出来时，阿米莉亚的母亲回来打算除掉兔子，但当她追着兔子进城时，他们成功地逃离了她，他们带着食物逃进了藏身处。巴拿巴后来带着彼得穿过小镇，谈论他的父亲过去如何为彼得和他的姐妹们偷东西来填饱肚子。托马斯和比亚随后找到彼得并将他带回家，而巴拿巴则返回他的藏身处。第二天早上，彼得向本杰明讲述了巴拿巴的事，并说服他和他的姐妹们和他一起去见船员。农贸市场，其中的重头戏是一包包干果。
托马斯和比亚再次与奈杰尔会面，讨论兔子的设计，但在让它们穿上现代服装后，奈杰尔为下一本书提出了更多建议。托马斯开始意识到奈杰尔的想法并不符合比亚工作的最佳利益。后来他甚至去拳击 馆与奈杰尔本人对峙，表达自己的感受，奈杰尔将其解释为他在为比亚说话。她发现了这一点，并对托马斯感到不满。
兔子们在动物朋友的帮助下完成了抢劫。这些动物会分散人们的注意力并消灭农民。兔子们正在准备干果箱，但在混乱中，一个奶酪轮碾过托马斯和他的西红柿他要卖掉。将干果装进逃跑卡车后，包括本杰明和姐妹在内的所有动物都被宠物饲养员捕获。令彼得沮丧的是，巴拿巴透露他一直在利用他和他的朋友为自己保留干果。他甚至解释说，他在书中读到彼得的故事后，故意在城里“撞见”彼得，因为他太老了，没人想要他，他花了很多时间感到愤怒。每个人都责怪彼得让他们陷入困境，而他却感觉非常糟糕。
彼得离开巴拿巴和他的帮派，去找托马斯，寻求他的帮助来救回他的朋友。卡车遇到障碍后，他们向 Bea 寻求帮助，而 Bea 正在与 Nigel 和出版公司的成员开会，他们想让 Peter 和他的朋友们经历一场荒唐的太空冒险，以及危险且不可预测的救援任务作为结束故事的一种方式。比亚意识到这不是她的初衷，她从奈杰尔的公司那里获取了自己的故事，因此现在知道托马斯对奈杰尔真实意图的理解是绝对正确的。与托马斯商量后，她同意帮助他和彼得找回所有朋友，同时执行超级任务来寻找他们。
彼得、本杰明和姐妹们在巴拿巴的藏身处最后一站。他们拿走了干果，结果船员们出现并抓住了彼得的家人。然后，他们做好了准备，扭转了局面，兔子用绞索把巴拿巴和他的船员吊起来，这样当附近的裁缝店老板开着卡车离开时，他们就被拉走了。然后，兔子将所有干果归还给主人，并在托马斯和比亚开车回家时与他们会合，彼得决定更愿意倾听那些爱他的人的声音。