1965年熊井启以真人真事为素材，以写实的手法拍摄了政治纪实性影片《日本列岛》。这部改编自吉原公一郎文学作品的影片，通过对美国占领时期第9研究所丢失一台赞梅尔印刷机所引发事件的层层追查，深刻揭露了一个无可辩驳的事实，即美国为了自己国家的利益而秘密赦免战争罪犯，然后招募他们从事军事医学研究，日后把研究成果使用于发动朝鲜战争及越南战争的军事进攻等。该片被《电影旬报》评为当年10大佳片第3名。有意思的是《日本列岛》完成后，日本警视厅曾强硬要求剪掉一部分带点性爱镜头的关键戏，理由是过于猥亵。
1959 年秋，S 营刑事调查科 (CID) 的波拉克中尉命令首席翻译秋山澄清里米特少校的案件。一年前，利米特一被发现死在水中，美军就无视日本警方，将尸体运回了祖国，并宣布他的死亡为意外事故。秋山想起自己心爱的妻子被美国大兵殴打，尸体被当成意外死亡的事件，再次怒火中烧。秋山和正在不懈追查此案的《昭和新报》记者原岛从警视厅搜查三课黑崎处得知，利米特正在追捕他去世前夕被送往日本的假币，他还了解到关于先进的德国制造的印刷机及其技术。我得知前伊集院少校失踪了。秋山拜访伊集院唯一的女儿和子，得知伊集院几年前被身份不明的男子绑架，而一个名叫唐泽的男子威胁一家人不让他们告诉其他人就离开了。唐泽是一名神秘男子，在美军占领期间活跃于阴谋机构。1954年，在新光会假币案中担任检察官的日高律师通过泷泽的下属佐佐木调查，发现有不良外国人在圣皮埃尔教堂出没。拜访佐佐木的秋山和原岛惊讶地发现佐佐木已经通知泷泽Limited正在追查假币。极限终于被唐泽消除了吗！？几天后，佐佐木变成了溺水身亡。突然，波拉克中尉命令秋山停止调查。秋山退出营地并继续调查。1935年，外籍空姐椎名佳代子被发现死在水中。以嫌疑人身份自首的圣皮埃尔教堂神父塞缪尔在审讯结束前突然返回日本。三年过去了，疑问也不少。1938年，当秋山从斯宾塞上尉那里听说冲绳有一个长得像伊集院的人自称“陈阳正”时，在征得和子的同意后，秋山飞往冲绳。然而，秋山和一名自称陈永成的男子均被人杀害，当局宣布真相永远不会为人所知。1939年，在和子的鼓励下，原岛飞往冲绳追查此案。