有谁会相信年仅十二岁的小菲利克斯把他们学校人见人恨的数学老师变成了身高仅有15厘米的小人？他不知道是怎么办到的，但这个举动却严重影响到了他们学校的生死存亡。他必须再把他的老师变回原来的大小，但是他该怎么做呢？在一系列的尝试与冒险中，菲利克斯变得越来越勇敢，越来越有担当。不仅在这次冒险中更加懂得了老师的良苦用心，也收获到了来自艾拉的友谊……
十一岁的菲利克斯算不上是一名明星学生，在被几所学校开除后，现在正在获得最后的机会。虽然他很快就找到了朋友艾拉，但主任兼班主任博士。施密特-戈森魏因是一个真正的稻草人。为了被班上的三个男孩录取，菲利克斯必须通过几项勇气考验。他本应在晚上闯入学校，但很快就被施密特-戈森温夫人抓住了。他只希望她立刻缩小到针尖大小。确实，老师突然缩了缩，躲进了菲利克斯的背包里。他们一起努力寻找原因。在此过程中，他们的同学马里奥和他的父亲、学校督察亨宁阻碍了他们。因为马里奥的父亲因注册人数太少而想关闭学校，并将其改造成精英学校。在研究过程中，菲利克斯揭开了一个与学校创始人精神相关的 100 年前的故事。所承诺的改革教师对学校下了诅咒，他自己也像幽灵一样出没在学校的走廊里。是他把老师缩小了。
随着故事的进展，艾拉发现菲利克斯博士。施密特-戈森温有洋娃娃那么大，他决定帮助他们俩。施密特-戈森葡萄酒落入马里奥手中，马里奥想折磨老师，然后将她喂给他的蛇。菲利克斯和艾拉可以救她。他们正好赶上亨宁先生想要正式关闭学校的会议。施密特-戈森魏因还是太小了，不敢暴露自己。虽然菲利克斯可以出示登记表，但董事的签名却难以辨认。当亨宁告诉他导演已经申请调职时，他失望地回家，通过Skype与母亲交谈想要传达坏消息的会议。亨宁离开了会议，但当他遇到施密特-戈森魏因时，他也退缩了。两人从活板门掉下来，被困在地下迷宫中。更糟糕的是，校猫紧追不舍。与此同时，马里奥和伙伴们抓住了艾拉，艾拉正试图独自拯救老师和学校董事会。
菲利克斯改变了主意，决定再尝试一次来拯救学校。当他进入地下室时，他首先遇到了马里奥和他的两个朋友以及被囚禁的艾拉。然而，艾拉和他可以让另外两个男孩相信马里奥并不关心与他的伙伴们的友谊，因为他很早就知道他父亲的计划。由于这两个朋友的父母永远无法支付学费，友谊只是时间问题。然而最后，马里奥也认识到了他父亲所处的困境，五个孩子现在试图一起解救他们。房子的地下室有一个隐藏的课程地理和数学领域的任务导致两名成年人被困。五人齐心协力就能解决所有任务，并释放学校董事会亨宁和施密特-戈森温夫人。在发誓从现在开始确保学校的未来后，这种精神将他们转变回来。两人随后共同开启了新的知识课程。