代号47（蒂莫西•奥利分特饰）是一个利用基因技术制作的复制人，受雇于名为“TheAgency”的组织进行刺杀活动，47是他颈背条码的最后两个数字，也是他的名字。因为卷入了政治阴谋，47在东欧遭到了国际刑警和俄国军队的双重追杀。在追查真凶的过程中，他遇上了一个致命的女人（欧嘉•克瑞兰蔻饰）。杀手的冷酷无情渐渐被女人瓦解，但是生命也正在受到威胁……
47号特工（蒂莫西·奥利芬特饰）没有名字，因为他从出生起就是一个孤儿，被一个名为“中情局”的神秘组织抚养长大，该组织“为所有政府所知”，并受雇执行暗杀行动。他接受过所有杀戮技能的训练，却没有接受过任何人类技能的训练，这就是为什么年轻女子妮卡（欧嘉·柯瑞兰寇饰）对他来说是一个巨大的挑战。一名妓女被俄罗斯总统的贩毒兄弟奴役，她跟随他，服从他，向他献身，尽管他仍然疏远，但 47 不能保持冷漠。
47号特工在俄罗斯执行一项任务：刺杀总统贝利科夫（乌尔里希·汤姆森饰）。他认为他做到了。然而，贝利科夫在袭击发生后几乎立即出现在公众面前，还活着并说话。这怎么发生的？国际刑警组织特工迈克（多格雷·斯科特饰）也同样困惑：“我的人不会失手。”
事情是如何发生的不关我的事，但我要说的是，47号特工被中情局出卖，并发现自己受到国际刑警组织和俄罗斯秘密警察的追捕。当他和尼卡从圣彼得堡搬到莫斯科时，发生了一场又一场枪战、九死一生、大胆跃入虚空、高科技陷阱等等。