本片是以地球人与瓦肯人的“第一类接触”事件为背景，将重心放在《星际迷航之下一代》电视系列剧中的大敌『博格人』。企业号正在宇宙空间做例行巡航时，舰长皮卡特接到密电，称博格人已联合其他星系的力量，准备向地球发起攻击。由于舰长皮卡特曾受敌方俘虏并同化，星际舰队对其不很信任，故没有派其出战。皮卡特不顾命令，仍然参与战斗，之后企业号跟随博格人的时间漩涡回到21世纪，以阻挡博格人试图改变人类的外星发展史达到征服地球的企图。
皮卡德在电视连续剧中与博格化有过接触，因此他一反常态地复仇。在经历了廉价的地下室光学效应后，船员们发现自己身处 21 世纪的地球，瑞克（弗雷克斯饰）和乔迪（莱瓦尔·伯顿饰）——现在戴着一对极小的电子眼——努力确保人类的第一次亚空间旅行在没有任何干扰的情况下进行。一个障碍。
《星际迷航：首次接触》接收此消息并运行。影片中没有一个群体不试图以某种非常有意义的方式改善自己，但每个群体都有一个改善自己的想法，这使他们与其他人发生直接冲突。正是在这方面，《第一次接触》是所有《星际迷航》电影中最理想主义的一部，尽管它是最黑暗的。并不是说你从表面上就知道这一点，因为《第一次接触》是一部动作恐怖片。然而，它成功地将这两个想法完美地结合在一起，至少在这方面，《第一次接触》可能是一部完美的《星际迷航》电影。